馬雅各(Dr. James Laidlaw Maxwell)於 1866 年來台成立第一個西醫醫院，取名為「打狗醫館」。同時，他也是第一位來台的西醫師。高雄市政府期許高醫團隊的經營能秉持馬雅各來台的初衷，照顧旗津區的居民。高雄市立旗津醫院除提供門診、急診外，也提供有特色的醫療服務。
1.本院設置復健、透析服務、中醫及開刀房等，提供完整醫療科別，全人照護。
2.本院引進旗津區第一台的 128 切 CT 服務。
3.旗津醫院的經營與高雄醫學大學附設中和紀念醫院、市立小港醫院和市立大同醫院進行垂直整合的醫療照護， 並加強與衛生所及在地診所之聯繫，提供一個完善的健康照護網絡本院以「強化在地醫療服務、發展特色照護模式」作為設立宗旨，並以「守護旗津世代健康，成為全人照護標竿社區醫院」為未來願景。秉持下列理念：1.落實以病人為中心、病人安全為主軸的品質。2. 整合在地資源，深耕社區，落實健康促進。3. 開發特色醫療，開發市場及增進醫療品質。除此之外，本醫院也著重社區服務之策略發展，加強對當地的全人照護。
本醫院整合在地資源，積極地進行多元化社區服務，致力於健康促進之理念。同時鼓勵當地居民熱切參與。從開院至今，本院在社區舉辦社區衛教、社區篩檢、社區活動，及來自高雄醫學大學護理系學生深入社區做居家關懷。本院也因此先後獲得衛生世界組織(WHO)的「健康促進醫院暨服務機構」認證、「高齡友善健康照護機構」認證，財政部第 14 屆民間參與公共建設金擘獎「佳等獎」和「公益獎」及其他來自衛生福利部與高雄市政府衛生局的獎項知殊榮。未來，本院持續努力經營社區服務，促進疾病預防、加強社區醫療健康照護，共同打造全人照護的旗津島。
未來，希冀能以高雄醫學大學的知識背景及本院的醫療暨服務之資源為基礎，建置旗津區的世代研究，將其研究結果造福當地民眾的健康，也期許能將豐碩的成果貢獻於國內與國際。未來，本院持續提供醫療、預防保健等醫療服務，完全實現成為旗津鄰里「好厝邊」的醫療服務理念，並打造以長期照護及慢性疾病之醫療照護網絡，進而完成守護旗津地區民眾之健康之使命。